LLM 위키에서 AI 사이언티스트까지
파일 기반 외장 두뇌에서 자율 연구 폐쇄루프까지 — 2024-08부터 2026-04까지의 진화
Karpathy의 파일 기반 LLM 위키에서 폐쇄루프 AI 사이언티스트까지. — 4 Parts, 12 Chapters
First published: 2026-05-22 | Last updated: 2026-05-22
4-레이어 분류
LLM Wiki / Paper-to-Agent / Agentic Research Associate / AI Scientist — 한 덩어리로 묶이던 개념을 운용 가능한 4계층으로 분해.
6-Level 성숙도 로드맵
L0 일회 요약에서 L6 wet-lab 폐쇄루프까지, 본인이 어디에 있고 다음 단계가 무엇인지 자가 진단.
2026-04 LLM Wiki 폭발
Karpathy gist 16M+ view 이후 한 달 반 동안 등장한 GitHub repo·블로그·영상 매트릭스를 한곳에.
자체 LLM 없이 시작하는 튜토리얼
Claude Code/Codex + Obsidian만으로 LLM Wiki를 짓고 AI Scientist 환경까지 단계적으로 확장.
Part I: 왜·무엇이 다른가 — 연구방법론의 패러다임 시프트
AI 시대 연구의 패러다임 시프트
Karpathy autoresearch, Anthropic AAR, Google AI Co-Scientist가 2026-04 같은 시기에 나온 의미. Brain Augmentation 철학에서 출발한 외장 두뇌의 정당성.
→ 024-레이어 분류 — LLM Wiki / Paper-to-Agent / Research Associate / AI Scientist
두 개념(LLM Wiki ↔ AI Scientist) 사이의 누락된 중간 계층 — Paper-to-Agent와 Agentic Research Associate. 각 계층의 역할·산출물·예시.
→ 03시간선 + 6-Level 성숙도 로드맵
2024-08 Sakana → 2025-02 Google co-scientist → 2025-12 Codex/GPT-5.5 → 2026-03 autoresearch → 2026-04 Karpathy LLM Wiki. L0~L6 자가 진단 체크리스트.
→Part II: LLM Wiki — 외장 지식 엔진
Karpathy의 LLM Wiki 패턴 — 16M view 회고
2026-04-04 gist의 원형, 'Obsidian as IDE / LLM as programmer / wiki as codebase' 비유, raw·wiki 3-레이어, CLAUDE.md/AGENTS.md 역할, RAG와의 본질적 차이.
→ 05폭발한 OSS·콘텐츠 매트릭스 (2026-04+ 집중)
Astro-Han·lucasastorian·ussumant·ekadetov·OmegaWiki·Mcptube GitHub repo, MindStudio·GeekNews 블로그, 'Full Beginner Setup Guide' 영상 계열, HN/Reddit 바이럴 흐름.
→ 06연구용 LLM Wiki 스키마 — wiki rot 막는 설계
claims·contradictions·open-questions·experiment-ideas 디렉토리, claim schema(Evidence/Confidence/Scope/Next exp), fact/inference/speculation 분리, prompt injection 방어, 평가 지표.
→Part III: Paper-to-Agent에서 AI Scientist로 — 자율 발견의 진화
The AI Scientist 계보 — Sakana 2408에서 AI Co-Scientist까지
Sakana v1(Lu et al. 2024, arXiv:2408.06292) → v2 agentic tree-search → Google AI Co-Scientist(arXiv:2502.18864, Elo tournament) → AI-Researcher → Deep Researcher Agent → Agentic Researcher.
→ 08Paper-to-Agent + 자율 실험 — autoresearch · AAR · Paper2Agent
Karpathy autoresearch(2026-03, 700실험/GPT-2 11% 단축), Anthropic AAR(Opus 4.6×9, PGR 0.97), Paper2Agent의 MCP 변환, PaperQA2/FutureHouse, multi-agent+tool use+sandbox+reflection 공통 패턴.
→ 09분야별 실전 — ML · alignment · biomedical · materials · medical
ML(autoresearch), Alignment(AAR), Biomedical(co-scientist AML/간섬유증/AMR wet-lab), Materials(SciAgents 지식그래프), Medical(medical-ai-scientist), Self-Driving Labs(SDL).
→Part IV: 외장두뇌 튜토리얼 — 본인만의 연구 OS 짓기
자체 LLM 없이 시작하기 — Claude Code/Codex + Obsidian
도구 설치, AGENTS.md/CLAUDE.md 첫 작성, subagents·skills·hooks·MCP 연구 활용, hook으로 강제할 7가지 규칙(citation·raw immutability·data boundary·robot safety 등).
→ 11terry의 워크플로우 케이스 — Obsidian × terryum.ai
terryum.ai의 papers·essays·notes·surveys 구조, terry-papers 지식그래프, /post·/paper·/paper-search·/survey 스킬 파이프라인, 한 줄 흐름: PDF → 요약 → KB 노드 → 다음 추천 → 책.
→ 12본인만의 AI scientist 환경 — 단계별 로드맵
L2 LLM Wiki(주제 1개·논문 30-50개) → L3 Paper-to-Agent(핵심 3편) → L4 Codex/Claude Code 연구 repo → L5 dry-lab AI Scientist(DOE/BO) → L6 wet-lab bounded autonomy. 리스크·평가·윤리·체크리스트.
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